Ninja 400 je vybavena moderním a propracovaným kokpitem, podobným jako u silnější Ninji ZX-6R. Přístrojový panel je vybaven velkým analogovým otáčkoměrem s ukazatelem zařazeného rychlostního stupně a hodinami, lemovaný výstražnými kontrolkami na jedné straně a multifunkčním LCD displejem zobrazující aktuální rychlost, palivoměr a další údaje na straně druhé.